Jak podaje strona PZPN po dwa najlepsze zespoły z szesnastu województw utworzą cztery międzywojewódzkie ligi (po osiem drużyn, mecz i rewanż) w obu kategoriach wiekowych. Tylko pierwsze zespoły awansują do ogólnopolskich finałowych turniejów.
Nowością są międzywojewódzkie ligi. Poprzednio, szesnastu mistrzów województw było wyłanianych dopiero wiosną, następnie rozgrywano dwie rundy pucharowe, z których cztery zespoły kwalifikowały się do finałowego ogólnopolskiego turnieju. W zeszłym sezonie, mistrzostwo juniorów zdobyła Arka przed Lechem, Pogonią i Zagłębiem; juniorów młodszych: Lechia przed Lechem, Zagłębiem i Stomilem.
Trenerzy wielu czołowych drużyn juniorów krytykowali stary system, przede wszystkim jej pierwszą fazę. W kilku województwach, najlepsze zespoły nie miały godnych rywali, a dwucyfrowe wyniki były niemal normą. - Z punktu widzenia szkoleniowego takie mecze nie miały sensu, dołowały słabszych, nic nie uczyły silniejszych – argumentowali.
Poniżej podział drużyn na cztery międzywojewódzkie ligi juniorów oraz juniorów młodszych na rundę wiosenną obecnego sezonie. Z szesnastu spółek T-Mobile Ekstraklasy - siedem jest reprezentowanych w obu kategoriach wiekowych: Jagiellonia, Korona, Lech, Lechia, Legia, Śląsk i Zagłębie; trzy – przez jedną: GKS, Pogoń i Wisła.
UKS Ruch Chorzów i MKS Polonia Warszawa to podmioty niezależne od występujących w ekstraklasie klubów-spółek Ruch Chorzów SA (spółka ma własne drużyny młodzieżowe) oraz KSP Polonia Warszawa SA (w planach jest zacieśnienie współpracy z MKS).
Z osiemnastu spółek albo stowarzyszeń pierwszej ligi po dwa zespoły ma pięć klubów: Arka, MKS Sandecja, Stomil (formalnie OKS 1945), Warta i Zawisza; po jednym - dwa: Bogdanka i Cracovia.
Z klubów spoza ekstraklasy i pierwszej ligi, oprócz MKS Polonia, w obu kategoriach wiekowych awansowały drużyny Bałtyku Koszalin, Gwarka Zabrze, KSZO Junior, SMS Łódź i UKP Zielona Góra.
Międzywojewódzkie ligi juniorów - wiosna 2013
(spółka) – oznacza, że młodzieżowy zespół należy do spółki albo jest od niej zależny
| Dolnośląska/Lubuska/Opolska/Śląska |
|
Śląsk Wrocław (spółka), Zagłębie Lubin (spółka); Stelmet UKP Zielona Góra i Stal Sulęcin; MKS MOSiR Opole, PLUKS Pomologia Prószków; UKS Ruch Chorzów i SKS Gwarek Zabrze |
| Kujawsko-Pomorska/Pomorska/Wielkopolska/Zachodniopomorska |
| Elana Toruń, Zawisza Bydgoszcz (spółka); Lechia Gdańsk (spółka), Arka Gdynia (spółka); Lech Poznań (spółka) i Warta Poznań (spółka); Pogoń Szczecin (spółka), Bałtyk Koszalin |
| Lubelska/Małopolska/Podkarpacka/Świętokrzyska |
| GKS Bogdanka (spółka), UKS Widok Lublin; Sandecja Nowy Sącz, Cracovia (spółka); Stal Rzeszów, Stal Stalowa Wola; Korona Kielce (spółka) i KSZO Junior Ostrowiec |
| Łódzka/Mazowiecka/Podlaska/Warmińsko-Mazurska |
| UKS SMS Łódź i Akademia Piłkarska ŁKS; Legia Warszawa (spółka), MKS Polonia Warszawa; Jagiellonia Białystok (spółka), ŁKS 1926 Łomża; Stomil Olsztyn, Sokół Ostróda |
Międzywojewódzkie ligi juniorów młodszych - wiosna 2013
(spółka) – oznacza, że młodzieżowy zespół należy do spółki albo jest od niej zależny
| Dolnośląska/Lubuska/Opolska/Śląska |
| Zagłębie Lubin (spółka), Śląsk Wrocław (spółka); Stelmet UKP Zielona Góra, Tęcza Krosno Odrzańskie; Odra Opole, Stal Brzeg; KS Stadion Śląski Chorzów i SKS Gwarek Zabrze |
| Kujawsko-Pomorska/Pomorska/Wielkopolska/Zachodniopomorska |
| Zawisza Bydgoszcz (spółka), Chemik Orto Przem Bydgoszcz, Arka Gdynia (spółka), Lechia Gdańsk (spółka), Lech Poznań (spółka) i Warta Poznań (spółka), Bałtyk Koszalin, Salos Szczecin |
| Lubelska/Małopolska/Podkarpacka/Świętokrzyska |
| BKS Lublin, Motor Lublin; Sandecja Nowy Sącz, Wisła Kraków (spółka); Stal Mielec, Karpaty Krosno; Korona Kielce (spółka), KSZO Junior Ostrowiec |
| Łódzka/Mazowiecka/Podlaska/Warmińsko-Mazurska |
| UKS SMS Łódź i GKS Bełchatów (spółka); Legia Warszawa (spółka), MKS Polonia Warszawa; MOSP Jagiellonia Białystok, Jagiellonia Białystok (spółka); Stomil Olsztyn, Jeziorak Iława |
